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En 1998, dans le cadre du premier concours de la Fondation canadienne pour l’innovation, six chercheurs du Centre de recherche du CHUL travaillant sur les maladies héréditaires humaines, Nicholas Barden, Jacques Brown, Rachel Laframboise, Jean Morissette, Vincent Raymond et Jacques Simard, se sont regroupés pour mettre sur pied l’Unité de génotypage et de séquençage à haut débit du CRCHUL. Au fil des années, Patrick Couture, Chantal Guillemette et Marie-Claude Vohl sont devenus des partenaires de cette unité.

En 2000, l’Unité devint la Plateforme de séquençage et de génotypage du Centre de recherche du CHUL. Depuis cette date, la Plateforme offre aux chercheurs universitaires et corporatifs un service de séquençage index.jpg et de génotypage de l’ADN à la fine pointe de la technologie. Grâce à la robotique et à la bio-informatique, nous offrons un service de séquençage et de génotypage adapté aux différents besoins, soit de quelques échantillons à plusieurs centaines quotidiennement. Nous offrons également un service de séquençage à haut débit pour les projets nécessitant l’analyse de plusieurs milliers de séquences d’ADN. Les échantillons sont analysés par électrophorèse sur capillaires grâce à un séquenceur de type ABI 3730/xl.

Les services de génotypage que nous offrons sont réalisés sur le ABI 3130xl, le ABI 7500 et sur notre toute dernière plateforme, le MassARRAY Systems de Sequenom, idéale pour multiplexer jusqu’à 34 SNP, que ce soit sur une centaine d’échantillons d’ADN ou plusieurs milliers.

Au cours de la dernière année, 367 scientifiques provenant de 170 laboratoires ont fait appel à nos services. La plateforme a séquencé 145 799 échantillons et analysé 160 000 génotypes de type microsatellite. Il fut également analysé durant cette même période plus de 1.5 million de génotypes de type SNP par spectrométrie de masses sur le « Mass Array Analyser » de Sequenom.

Marc-André Rodrigue,
Directeur des opérations
2011-04-01